Indeks geometryczny

Z testwiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania

W chemii koordynacyjnej, strukturalnej oraz krystalografii indeks geometryczny lub parametr strukturalny (τ) jest liczbą w zakresie 0-1, która informuje o geometrii wokół atomu centralnego cząsteczki (zwykle centrum koordynacji). Pierwszy taki parametr dla związków 5-koordynacyjnych został zaproponowany w 1984 roku. Później opracowano również parametry dla związków 4-koordynacyjnych. Opracowana została również aplikacja on-line do wyznaczania indeksów geometrycznych na podstawie strukturalnych plików 3D[1].

Związki 5-koordynacyjne

By ocenić, czy geometria centrum koordynacji o LK = 5 zbliżona jest bardziej do bipiramidy trygonalnej, czy piramidy kwadratowej Addison et al. zaproponowali w 1984 roku parametr τ5 (w oryginalnej pracy po prostu τ)[2]:

τ5=βα600,01667α+0,01667β,

gdzie: β>α to dwa największe kąty walencyjne centrum koordynacji.

Gdy parametr τ5 jest bliski 0, to geometria zbliżona jest do piramidy kwadratowej, natomiast gdy jest on bliski 1, to geometria zbliża się do bipiramidy trygonalnej:


Związki 4-koordynacyjne

Poprzez analogię, w 2007 roku Yang et al. zaproponowali parametr τ4 dla związków o LK = 4, aby ocenić czy ich geometria jest bardziej zbliżona do płaskiej kwadratowej, czy tetraedrycznej[3]:

τ4=360(α+β)3602θ0,00709α0,00709β+2,55,

gdzie: α i β to dwa największe kąty walencyjne centrum koordynacji; θ=cos1(13)109,5 to kąt tetraedryczny.

Gdy parametr τ4 jest bliski 0, to geometria jest zbliżona do płaskiej kwadratowej, natomiast gdy jest on bliski 1, to geometria zbliża się do tetraedrycznej. Niestety parametr ten (w przeciwieństwie do τ5) nie różnicuje kątów α i β, przez co struktury o znacząco różniących się geometriach mogą mieć identyczną wartość parametru τ4. By przezwyciężyć tę niedogodność w 2015 roku Okuniewski et al. zaproponowali parametr τ4, który przybiera wartości zbliżone do τ4, jednak lepiej różnicuje rozpatrywane struktury[4]:

τ4=βα360θ+180β180θ0,00399α0,01019β+2,55

gdzie: β>α to dwa największe kąty walencyjne centrum koordynacji; θ=cos1(13)109,5 to kąt tetraedryczny.

Wartości graniczne parametrów τ4 i τ4 definiują dokładnie te same geometrie skrajne, jednak parametr τ4 jest zawsze mniejszy lub równy parametrowi τ4, przez co nawet niewielkie odchylenia od geometrii tetraedru są bardziej zauważalne. Jeżeli dla kompleksu tetraedrycznego wartość parametru τ4 jest mała, to należy sprawdzić, czy w obrębie centrum koordynacji nie występują dodatkowe oddziaływania. Przykładowo dla kompleksów rtęci(II) udało się w ten sposób odnaleźć oddziaływania Hg···π[5].



Przypisy

Szablon:Przypisy